Metodický seminář „Jak na mikrobiom“
Dobrý den,
v České mikrobiomové společnosti si uvědomujeme, jak nesmírně dynamický je vývoj ve všech oblastech výzkumu mikrobiomu. Pro osamoceného výzkumníka či výzkumnici je docela obtížné udržet krok s dobou ve všem, ale my jsme, stejně jako bakterie v biofilmu (Buď jako bakterie, spolupracuj!) vsadili na spolupráci a nabízíme metodický seminář. Půjde především o přátelskou výměnu zkušeností – v každém bloku přednášek bude vyhrazena delší doba pro diskuzi, sdílení vašich zkušeností a řešení problémů.
Kdy:
bude upřesněno dle zájmu
říjen 2025
listopad 2025
březen 2026
Cena: Cca 5000 Kč
Předběžný program:
- Sekvenační technologie a novinky
- Sekvenace genu 16S rRNA
-
- příprava knihoven pro sekvenování krátkých amplikonů
- příprava knihoven pro sekvenování celého genu 16S RNA
- bioinformatická analýza dat
- Celometagenomové sekvenování,
- příprava knihoven
- zkušenosti se sekvenacemi z přístrojů využívajících technologii dlouhého čtení
- bioinformatické zpracování dat
- Představení sekvenačních služeb
- Biostatistika v analýze mikrobiomu – nahrazování chybějících hodnot, filtrace dat, alfa a beta diverzita, diferenční abundanční analýza, prediktivní modely
Naším cílem není nerealisticky učit laboratorní protokoly nebo provádět kompletní bioinformatické a statistické analýzy, ale spíše upozornit na klíčové kroky, které by analýza mikrobiomu měla obsahovat, a vysvětlit jejich význam. A především – otevřít prostor pro diskuzi, protože, jak víme, v oblasti mikrobiomu mají tři vědci minimálně pět názorů! 😊
Abychom mohli seminář lépe naplánovat, prosíme vás o vyjádření předběžného zájmu prostřednictvím odkazu níže.
https://forms.gle/VddByRcNuMHMis1D8
Těšíme se na setkání
Petra Vídeňská
Monika Cahová